Tras haber colgado las botas en la temporada 04-05 en las filas del Espanyol a los 33 años, José Emilio Amavisca sigue en contacto con el balón a través de la dirección de las Escuelas Municipales de Fútbol en Santander y también mediante el comentario en medios de comunicación de los encuentros disputados por el Real Madrid.